1、除蛋白
除蛋白的技术主要应用于动物多糖的提取，以新鲜组织或丙酮脱脂脱水的组织为原料，可用水或盐溶液提取部分黏多糖。但因大部分黏多糖是与蛋白质结合的，需用酶降解蛋白质部分或（和）用碱使多糖蛋白质间的键裂开，以促进黏多糖在提取时的溶解。在碱性提取的同时用蛋白质酶处理组织，可将提取过程简化。多糖中的游离蛋白质可用蛋白沉淀剂除去，少量蛋白质则用Sevag法除去。对于微生物多糖则用三氟三氯乙烷法；而植物多糖就可用三氯乙酸法脱游离蛋白质。
2、去离子
去离子是为以后进一步纯化及色谱分析作准备，最古老的去离子方法是透析法。必须选择一种规格适宜的透析膜，以免样品损失。透析法不仅能去盐，也可以除去各种小分子物质。使用柱离子交换法以达到去离子作用，本法比较简单，但是增大了溶液的体积，影响多糖的沉淀结果。
纤维滤器透析法根据膜技术而新发展起来的，以这种方式对大多数样品进行浓缩速度很快，而且温和，所以即使发生失活也是很少量的。利用不同孔径的膜有可能使大小不同的分子分级。但这个方法的分辨率要比分子筛色谱可能达到的小得多。
3、乙醇沉淀
用乙醇沉淀是一种从溶液中定量回收多糖的简单方法，由于不同性质或不同分子量的多糖沉淀所需乙醇浓度不同，它同样也可以用于样品中不同多糖组分的分级分离。要根据具体情况使用不同浓度的乙醇，其中需要考虑的包括多糖的浓度及盐浓度。